提起三大神刊CNS(Cell、Nature、Science),每個搞科研(或被科研搞)的人應(yīng)該都有所耳聞。Nature 和Science刊發(fā)的是各個學(xué)科最前沿的研究成果,出現(xiàn)化學(xué)領(lǐng)域的大作十分常見。Cell,顧名思義是“細(xì)胞”,似乎和化學(xué)分屬兩個不同的一級學(xué)科。可是,最近Cell 雜志刊發(fā)了一篇和化學(xué)密切相關(guān)的研究論文,著實(shí)讓人震驚(標(biāo)題用了“震驚!”體,諸君勿怪~~)。這么有意義的事件,本君自然不會放過,今天就為大家簡要梳理一下這篇文章。
看論文標(biāo)題中的關(guān)鍵字“Novel Lead”,諸君大概猜到了,這篇發(fā)在Cell 上的文章居然來自藥物化學(xué)領(lǐng)域。那么這個“新型先導(dǎo)化合物”是從何而來?文章又是哪里出彩才得到眼高于頂?shù)腃ell 編輯部的青睞?
咱們擰掉文章里的水份直接上干貨。化合物TAM1是美國德克薩斯A&M大學(xué)James C. Sacchettini 教授團(tuán)隊(duì)前期發(fā)現(xiàn)的抗結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)的活性化合物,并且證明了聚酮合酶13(Polyketide Synthase 13,PKs13)是該化合物的直接作用靶點(diǎn)。作者發(fā)現(xiàn)TAM1耐藥的突變株中,PKs13的硫酯酶(TE)結(jié)構(gòu)域中都能找到突變氨基酸。因此,作者明確了要研究TAM1對PKs13 TE結(jié)構(gòu)域的作用。
作者先選用生化反應(yīng)來評價TAM1對PKs13-TE具有抑制作用,并且明確作用強(qiáng)度(IC50 = 0.26 μM);然后直接祭出大殺器X-Ray共晶結(jié)構(gòu),詳細(xì)解析了TAM1與PKs13-TE的精確作用形式。咱還是直接上圖吧。
有了共晶結(jié)果,做化合物的結(jié)構(gòu)修飾自然是事半功倍了,具體怎么增減基團(tuán)似乎容易很多。值得一提的是,作者在優(yōu)化結(jié)構(gòu)的時候始終關(guān)注化合物的理化性質(zhì)和代謝性質(zhì)。最終得到了活性較TAM1提高兩個數(shù)量級的化合物TAM16。咱們還是直接看看人家的結(jié)構(gòu)修飾梗概吧。
既然TAM16的活性這么好,按照常規(guī)套路就該評價其他性質(zhì)了,比如藥代動力學(xué)啦,毒性啦,體內(nèi)藥效啦。這篇文章是一個都沒少。先看看理化性質(zhì)和藥代動力學(xué)參數(shù)吧。要不說人家這化合物發(fā)了Cell 呢,至少本君是沒從下表參數(shù)中看到明顯的缺陷。大寫的“服”字!
關(guān)于TAM16的毒性評價,作者做了一些細(xì)胞毒作用,小鼠連續(xù)3天單次給藥300 mg/kg的急性毒性評價,對主要CYP異構(gòu)體的抑制作用,對hERG的抑制作用,以及基因毒性。結(jié)果都相當(dāng)喜人,由于TAM16沒有什么毒性作用,作者也就沒給出什么實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
藥代毒理都說的差不多了就輪到了藥效。由于結(jié)核分枝桿菌存在著多種耐藥突變,所以作者還評價了TAM16對常見耐藥菌株的作用,結(jié)果也是可圈可點(diǎn)。
文末,作者用結(jié)核動物模型評價了TAM16的體內(nèi)藥效,該化合物體內(nèi)藥效十分顯著,與異煙肼(isoniazid,INH)不相上下。(個人感覺,此處看柱狀圖不如看肺組織來的直接,所以我從支持信息中特意扒出來一張肺組織圖片,估計外行也能看明白吧。)
經(jīng)過這么一番拆解,想必大家對這篇文章的思(套)路已經(jīng)了然于胸啦。說句實(shí)在話,本君真沒覺得這篇文章比那些發(fā)在J. Med. Chem. 上的文章巧妙多少,至少在藥物化學(xué)理論或方法上沒見到技驚四座的創(chuàng)新。但是,無可辯駁的是TAM16這個化合物的理化性質(zhì)、藥代性質(zhì)、安全性、有效性都非常優(yōu)秀,整篇文章的工作也沿襲了Cell 文章系統(tǒng)性高的一貫作風(fēng)。在國內(nèi)對影響因子迷之崇拜的氛圍下,做創(chuàng)新藥物的大團(tuán)隊(duì)或許有一天也能在CNS上發(fā)表文章。不過令人擔(dān)憂的是,這也給某些外行領(lǐng)導(dǎo)手里塞了一條強(qiáng)硬的“證據(jù)”,他們可以大模大樣地把這篇論文甩在研發(fā)人員臉上,“別老說做新藥發(fā)不了高分文章,看看人家,也是開發(fā)新藥的,都發(fā)Cell 了……”
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