蛋白連接酶是負(fù)責(zé)催化兩個多肽/蛋白之間或者同一多肽兩個末端之間的肽鍵形成的一類酶。蛋白連接酶是一種非常重要的蛋白工程操控的工具。相對于大量存在的蛋白水解酶,蛋白連接酶非常少見,而且通常催化效率較低,只能相對有效地催化小分子肽之間的連接。在催化大分子蛋白之間的連接時通常效率較低,需要非常大量的蛋白連接酶達(dá)到目的。因此,深入研究蛋白酶,發(fā)現(xiàn)新的或者改造已有的蛋白酶具有重要的科學(xué)研究與實用價值。
2015年,澳大利亞的Anderson, M. A.課題組從白花蛇舌草中發(fā)現(xiàn)了識別天門酰胺底物的多肽連接酶,但這種酶的催化效率較低 (Nat. Commun., 2015, 6, 10199)。近日,新加坡南洋理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院結(jié)構(gòu)所的吳彬教授(點擊查看介紹)和Julien Lescar教授(點擊查看介紹)課題組共同合作,報道了白花蛇舌草天門酰胺蛋白連接酶的結(jié)構(gòu),這是世界上第一個天門酰胺連接酶的結(jié)構(gòu)。通過與同源結(jié)構(gòu)和蛋白序列相似度極高的天門酰胺水解酶(Legumain)的結(jié)構(gòu)進(jìn)行對比,他們發(fā)現(xiàn)最終可能決定蛋白酶抑或水解酶走向的關(guān)鍵因素。
不僅如此,他們還依據(jù)該連接酶的結(jié)構(gòu)對其進(jìn)行工程改造,發(fā)現(xiàn)只要突變一個氨基酸,便可使酶的催化效率提升近200倍,突變后的連接酶可以有效催化大分子蛋白質(zhì)之間的連接,這是野生型連接酶無法做到的,改進(jìn)后的蛋白連接酶成為一種重要、實用的蛋白工程操作的工具。
這一成果作為封面文章發(fā)表在國際頂級期刊Journal of the American Chemical Society 上,文章的第一作者是新加坡南洋理工大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院結(jié)構(gòu)所的博士后研究員楊仁良。該研究受到南洋理工大學(xué)結(jié)構(gòu)所博士后基金(楊仁良)以及南洋理工大學(xué)南洋助理教授啟動基金(吳彬)和AcRF Tier 1基金(Julien Lescar)的大力支持。
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